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形态解剖实验室主要承担结构植物学和植物生殖生物学的科学研究和应用研究。目前该实验室拥有LEICA EM UC6超薄切片机、HM340E切片机、UV4802紫外可见光分光光度计、LECIAST4040染色机、NIKON E400显微镜、DB-3不锈钢电热板、101-2数显鼓风干燥箱等一批先进仪器设备。为仙湖植物园相关课题研究及研究生毕业论文实验提供良好的实验条件。